2500’lerde Dünya’nın nüfusunun patlamasıyla birlikte kaynakların azalması, insanları başka gezegenlere göç etmeye zorluyor. Merkezi gezegenlere yerleşenler, medeniyeti sürdürüyor ve bir ittifak olan Alliance’ı kuruyorlar, bu ittifakın temelini ABD ve Çin oluşturuyor. Diğerleri ise çevre gezegenlere ve uydulara yerleşerek kendi bağımsızlıklarını ilan ediyorlar. Alliance, bu bağımsız grupları kendi bünyesine katmak için savaş başlatıyor. Dizinin pilot bölümü olan “Serenity”, bu savaşın ardından yaşananları ele alıyor. Savaşın sonunda, Kaptan Malcolm Reynolds (Mal), adını verdiği Firefly model bir uzay gemisini kaçırarak kaçakçılık işine girişiyor. Bu kaçış, onu ve ekibini, hem kendi hayatta kalma mücadelelerine hem de Alliance’ın baskıcı gücüne karşı verilen bir mücadeleye sürüklüyor.