Dexter: New Blood finalinin hemen sonrasından hikayeyi devralıyor. Oğlu Harrison’ın kurşunuyla ağır yaralanan Dexter, haftalar süren bir komadan uyanıyor. Kendine geldiğinde ise Harrison’ın ortadan kaybolduğunu öğreniyor. Vicdanıyla baş başa kalan Dexter, geçmişte oğluna yaşattığı travmalarla yüzleşerek onu bulmak ve yaptığı hataları telafi etmek için New York’a doğru yola çıkıyor. Ancak geçmiş peşini bırakmaz; Miami Metro’dan dedektif Angel Batista’nın soruşturma için ortaya çıkmasıyla Dexter, eski hayatıyla hesaplaşmak zorunda kalır.